- Sistem pendidikan Integritas, artinya Perpaduan dua sistem pondok pesantren di Indonesia :
- Sistem KMI Pondok Modern Gontor
- Sistem Pondok Pesantren Salaf Sidogiri
- Kurikulum Sekolah, menggunakan Kurikulum Nasional (SMP-SMA & MTs-MA) yang disisipkan didalamnya ( Al-Quran & Sunnah )
- Kurukulum Kepesantrenan dan entrepreneurship, mengacu pada kurikulum pesantren tradisional dan modern.
- Tatakrama dan kajian kitab kuning, mengacu pada kurikulum pesantren tradisional.
- Program Billingual, yaitu wajib berbahasa resmi Arab dan Inggris dalam lingkungan Pondok, dan dalam proses belajar mengajar.
- Disiplin dan pendidikan bahasa serta OSIS dan Kepemimpinan, mengacu pada kurikulum pesantren modern.